茶是世界重要的飲料作物，以迷人的香氣與多種有益健康的多酚化合物而深受廣大消費(fèi)者的喜愛。然而其滯后的基因組學(xué)研究極大限制了利用分子生物學(xué)技術(shù)進(jìn)行優(yōu)良性狀的快速選育。隨著第一個(gè)茶樹全基因組的測(cè)序完成，圍繞茶樹的研究如雨后春筍般相繼涌出，但烏龍茶系列最具代表性的品種“鐵觀音”的基因組圖譜尚未破譯，且茶樹的遺傳和演化歷史仍值得進(jìn)一步探究。
2021年7月15日，在福建農(nóng)林大學(xué)尤民生教授和張興坦研究員共同主持下，福建農(nóng)林大學(xué)聯(lián)合國(guó)內(nèi)外多家單位的科學(xué)家，共同合作，破解了鐵觀音基因組以及茶樹演化史，該論文發(fā)表于國(guó)際頂級(jí)期刊《自然遺傳學(xué)》（NatureGenetics）。課題組利用獨(dú)立開發(fā)的新算法攻克高雜合、高重復(fù)鐵觀音基因組組裝難題，在此基礎(chǔ)上闡述了等位基因不平衡、茶樹群體演化和馴化等相關(guān)科學(xué)問題。
該研究團(tuán)隊(duì)一是利用獨(dú)立開發(fā)算法成功攻克高雜合、高重復(fù)鐵觀音基因組組裝難題，拼接了兩套鐵觀音基因組；二是基于鐵觀音分型基因組組裝鑒定到14691個(gè)基因具有等位變異，通過(guò)分析顯示在無(wú)性繁殖的茶樹基因組中，顯性效應(yīng)可能是其應(yīng)對(duì)遺傳負(fù)荷的重要機(jī)制；三是通過(guò)對(duì)161個(gè)茶樹品種和15個(gè)近緣種進(jìn)行重測(cè)序分析等發(fā)現(xiàn)大葉茶與小葉茶存在不同的演化和馴化歷史。
該研究由福建農(nóng)林大學(xué)、深圳基因組所等多家單位合作完成。深圳基因組所張興坦研究員、福建農(nóng)林大學(xué)碩士研究生陳帥、福建省農(nóng)科院水稻所施龍清博士、中國(guó)農(nóng)科院煙草研究所龔達(dá)平副研究員為論文共同第一作者，福建農(nóng)林大學(xué)尤民生教授、唐海寶教授和深圳基因組所張興坦研究員為共同通訊作者。參與該項(xiàng)目的人員還包括福建農(nóng)林大學(xué)葉乃興、王海峰教授，趙茜、馬曉開博士，研究生張晟鋮、廖振陽(yáng)、王鵬杰、石巖、王毅斌、余嘉鑫、徐鑫丹、齊睿、王文玲、馬昀然、馬東娜、林京、魏柳鋒、馬亞影、李若愚、何海芳，杭州開泰生物技術(shù)公司詹東亮，加拿大布洛克大學(xué)LietteVasseur教授，福建省農(nóng)科院茶葉研究所孔祥瑞、江西省農(nóng)科院桑茶研究所胡桂萍博士，中南林業(yè)科技大學(xué)張琳教授，美國(guó)伊利諾伊大學(xué)香檳校區(qū)RayMing教授，中科院西雙版納熱帶植物園王剛研究員。
